Científicos mexicanos logran secuenciar genoma del coronavirus


Científicos mexicanos de la Universidad Nacional Autónoma de México (UNAM), del Instituto Nacional de Enfermedades Respiratorias (INER), del Instituto de Diagnóstico y Referencia Epidemiológicos, y del Instituto Nacional de Nutrición Salvador Zubirán lograron secuenciar el genoma del Covid-19 del primer paciente que llegó a México con la enfermedad.

Este descubrimiento científico se sumará a una base de datos internacional donde hasta el momento 22 países diferentes han secuenciado los genomas del virus que se está presentando en sus territorios. Esto permitirá conocer las especificidades del virus, cómo afecta la salud de las personas que lo adquieran de acuerdo con las características genéticas de la población de cada país y del virus que circule.

“El 11 de enero (China) publicó la secuencia completa del genoma del Coronavirus 2019. Esto es importante porque sirvió de base para los métodos diagnósticos que se están utilizando en todo el mundo, también para la estrategia de diseño de nuevas vacunas, y para la evaluación de nuevos antivirales. Esto también permitió seguir la distribución de los virus en China hacia otros países”, explicó Carlos Federico Arias Ortiz, investigador del Instituto de Biotecnología que trabaja en el equipo mexicano que ha caracterizado al virus que circula en el país.

Si el Covid fuera un delincuente, la secuencia genómica sería el retrato hablado y la descripción de su modus operandi. En esta metáfora, los equipos de científicos serían los investigadores que, de acuerdo con las características del virus que se han estudiado alrededor del mundo, determinan la manera en que su actividad afecta a la población de cada país, de acuerdo con su contexto local, y la mejor manera de detenerlo.

“Contamos con la secuencia del virus que nos va a permitir darle seguimiento en la población y su dispersión, ver de dónde vienen las nuevas introducciones no relacionadas con los casos que ya están aquí, la posible adaptación del virus en diferentes poblaciones o medio ambiente, y eventualmente cuando haya desarrollo de antivirales, dar seguimiento al surgimiento de cepas resistentes a esos antivirales”, contó Arias Ortiz en conferencia de prensa.

El estudio, en el que participaron científicos de las instituciones de salud más importantes del país, comenzó con una prueba piloto o ensayo que se llevó a cabo en enero pasado. El objetivo del piloto era generar un protocolo que les permitiera saber cómo secuenciar, de manera inmediata, el virus que llegara a México.

Para este ensayo se tomaron dos muestras del coronavirus que circula estacionalmente. Se reunieron los científicos de todas las instituciones y acordaron un protocolo único y optimizado que incluyera las estrategias que se utilizan en cada centro científico. La secuenciación piloto se logró tras cinco días de trabajo.

De esta manera, cuando se confirmó el primer caso de Covid 19 en México, los científicos ya estaban preparados y ayer domingo, lograron caracterizar el virus.

“Demostramos que podemos hacerlo, que tenemos la tecnología y capacidad de responder de manera rápida, desde el punto de vista científico, como lo han hecho en otras naciones”, explicó Arias Ortiz.

“La secuencia de este virus está muy asociada, tiene nada más tres o cuatro cambios, con el virus que se reportó de Brasil, que también venía de la misma zona de Lombardía (Italia). Esta cepa mexicana está cercanamente asociada a la de Lombardía y al caso brasileño que venia de la misma región. Como un cuarto componente de secuencias, es un virus proveniente de Alemania. Son como pequeñas huellas genéticas que nos permiten irle dando seguimiento a la dispersión del virus”, dijo.

Esto quiere decir que con el tiempo, la caracterización genómica en la que hoy trabajan los científicos mexicanos y de todo el mundo, permitirá estudiar el virus y desarrollar una vacuna.

Este proceso no ocurrirá hasta dentro de cuando menos un año, ya que se necesita hacer pruebas en laboratorio, después en animales y finalmente en seres humanos, pero con características muy específicas, explicaron integrantes de la Comisión Universitaria para la Atención de la Emergencia del Coronavirus de la UNAM.

Coronavirus, día a día

“Recientemente se ha reportado el primer protocolo y diseño de vacuna que ha demostrado la inmunogenicidad, la capacidad de generar anticuerpos”, explicó Yolanda López Vidal, académica de la Facultad de Medicina.

“Esta vacuna no estará disponible en un plazo breve: llevará al menos entre un año y un año y medio de garantizar, la seguridad, protección y eficacia en diferentes poblaciones en el mundo. Existe un primer prototipo, seguramente existirán muchos otros más y la colaboración internacional para la búsqueda de nuevos biológicos para contender contra esta emergencia estarán disponibles en un plazo no antes de año y medio”, finalizó.

EL CORONAVIRUS DE WUHAN

Genética del nuevo virus

31 DE ENERO DE 2020

Los coronavirus son un grupo de virus que causan enfermedades en mamíferos y aves. Los coronavirus humanos causan infecciones respiratorias, incluido el resfriado común. Pero algunas cepas, como el coronavirus recientemente identificado en China y las que causan el Síndrome Respiratorio de Oriente Medio (MERS) y el Síndrome Respiratorio Agudo Severo (SARS) pueden ser mortales.

Árbol familiar del coronavirus

El origen preciso del nuevo coronavirus aún no se ha confirmado, pero los investigadores que analizan su material genético dicen que los coronavirus de murciélago son su pariente más cercano. La Iniciativa GISAID, una plataforma de intercambio internacional, ha establecido que el genoma es 80% idéntico al virus del SARS y más diferente del MERS.

El salto a los humanos

Los coronavirus son zoonóticos, lo que significa que pueden pasar de animales a humanos. Según las investigaciones, el virus que causó el SARS probablemente se originó en los murciélagos y pasó a través de las civetas, mientra que el que causa el MERS probablemente pasó de murciélagos a camellos a humanos.

Los virus animales pueden mutar o combinarse con otros virus para crear nuevas cepas que puedan transmitirse a las personas. No está claro si el nuevo coronavirus pasó de murciélagos a humanos o a través de una especie intermediaria. Algunos científicos dicen que el nuevo coronavirus es el resultado de la recombinación viral, un proceso en el que más de un virus infecta la misma célula al mismo tiempo y crea una cepa modificada.

Contagio

Hay evidencia de que el nuevo coronavirus se puede transmitir ahora de persona a persona. Un virus sobrevive encontrando un huésped y usando sus células vivas para replicarse o reproducirse. Cuando un virus invade un huésped, ingresa a sus células y secuestra los sistemas de producción natural de la célula para hacer nuevas copias de sí mismo. El proceso de replicación puede provocar pequeños errores o cambios, lo que lleva a la mutación del virus.

Datos de GISAID muestran relaciones evolutivas de virus del nuevo brote de coronavirus. Se pueden apreciar grupos de infecciones relacionadas. Estas son señaladas por GISAID como “grupos familiares de infecciones”, que representan la transmisión directa de humano a humano.

Evolución del virus Relaciones genéticas entre 33 muestras Información al 29 de enero

El virus ha causado alarma porque todavía es pronto para saber qué tan peligroso es y con qué facilidad se propaga entre las personas. Las autoridades chinas dicen que es infeccioso durante la incubación, que podría variar de uno a 14 días.


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